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植物表型成像技術在生態學領域的應用：生態適應、競爭與氣候 變化響應
發布時間： 2024-10-15 點擊次數： 1918次作為一門研究生物與自然環境相互關系的學科，在生態學研究領域中，植物與環境的相互關系一直是非常重要的研究方向，具體研究內容包括而不限于：植物如何適應自然環境尤其是在嚴苛的環境條件下是如何適應與響應的；在特定生境下不同植物如何取得生態優勢并競爭生態位；在全球溫室效應背景下，植物如何應對逐漸升高的溫度、大氣CO2濃度以及如何借助植物實現碳中和等等。
從21世紀10年代開始逐漸受到極大關注的表型phenotype、表型組phenome、表型組學phenomics概念則與生態學的相關概念不謀而合。現代表型概念也同樣強調環境對表型的影響。如今如火如荼的植物表型組學主要就是研究相同基因型的植物在不同的環境條件的表型變化與應答。
因此，基于植物表型組學研究需求而在近十年中逐漸開發完善的植物表型成像技術也同樣可以用于與生態學研究領域。各種植物表型成像技術在生態學領域的作用請見下表：
國內外研究者利用易科泰及合作廠家提供的植物表型成像技術已經取得了大量生態研究成果，下面我們介紹其中的部分重要成果：
案例一、Who will win where and why? 牧草與入侵雜草的熱帶高山生態位競爭
在熱帶農業中，蕨類植物經常會入侵牧場，與普通牧草競爭。由于這種雜草的侵擾，人們經常放棄原有牧場，將熱帶森林開辟為新的放牧區，嚴重破壞生態系統生物多樣性。
德國奧斯納布呂克大學對厄瓜多爾安第斯熱帶草原上的兩種主要競爭植物——非洲狗尾草Setaria sphacelata和蕨類雜草Pteridium arachnoideum的生態競爭進行了研究。研究區衛星數據顯示，隨著海拔高度的增加，蕨類的競爭力逐漸增強。隨著海拔的升高，兩種植物的生物量比重逐漸向蕨類植物傾斜，在海拔1800 m以上，蕨類的生長能力超過了狗尾草。
研究人員考慮海拔高度變化中，溫度和紫外光輻射是對植物生長影響最大的兩個關鍵環境因素。在進一步的溫室試驗中，他們在溫室中模擬不同環境溫度并補充紫外光，同時用光合儀和FluorCam葉綠素熒光成像系統對在其中培養的狗尾草與蕨類光合作用進行測量。結果發現，狗尾草的凈光合速率要對低溫更敏感，而其光系統II最大光化學效率Fv/Fm在補充紫外光后顯著降低，這說明其光系統活性被紫外光嚴重抑制。蕨類對溫度不敏感的光合作用及其對紫外線輻射的有效保護是其能夠在生態競爭中獲得成功的原因。
再進一步的葉片黃酮與多酚等次生代謝物含量測量，則解釋了這其中的機制。黃酮類物質可以吸收UV-A、UV-B及藍光，從而有效屏蔽高能輻射對植物的損傷。同時黃酮也是抗氧化劑和ROS清除劑。結果發現，在高海拔地區，蕨類合成了大量的黃酮與多酚物質。而狗尾草的次生代謝水平則基本沒有變化。
由此研究人員得出結論，由于在低溫下較差的光合能力和無法為葉片細胞提供足夠紫外線屏障，使得狗尾草在這場高海拔生態位競爭中敗下陣來。
在這個案例中，研究人員使用了多臺儀器并通過較為復雜的色譜質譜分析來測量次生代謝水平。而現在的先進技術已經可以實現在一臺儀器上無損檢測植物葉綠素熒光與次生代謝水平。FluorTron®多功能高光譜成像分析系統既可以通過多激發光葉綠素熒光高光譜成像分析來測量植物的光合能力與光系統狀態；也可以利用UV-MCF紫外光激發生物熒光高光譜成像技術來檢測植物黃酮、多酚類物質的次生代謝水平；還可以進行高光譜成像分析，在空間維度和光譜維度上對物體表面反射光信息成像。所有這些成像功能均可對植物活體進行無損測量。
案例二、緯度策略？北方與南方銀樺的生態適應策略差異
在北方生長的樹木會受到生長期較短的限制。那么它們的生態適應策略又與生長在南方的同類有什么差異呢？
東芬蘭大學將北方（北緯67°）與南方（北緯61°）銀樺（Betula pendula Roth）在同樣的生長條件下進行培養。結果表明兩者的總干重、枝干重和根干重等沒有差異。而北方銀樺的葉干重更低，同時具備更高的凈光合速率（凈CO2同化速率）Anet和更高的氣孔導度gs，因此能達到與南方銀樺類似的總CO2同化速率。FluorCam葉綠素熒光成像結果則表明，北方銀樺具備更高的光系統II最大量子產額（最大光化學效率）Fv/Fm。同時，北方銀樺也具有更高的根生物量分數。
由此，研究人員確認，北方銀樺的高緯度生存策略：更高效的光合能力與更多投資地下生長，使其更能適應北極土壤，有益于其在自然與人工擴散過程中適應新氣候。這一研究成果發表于2021年《Tree Physiology》。
本研究中根系及地上部生物量的測量仍采用的是取樣洗根、干燥稱重的傳統方法。這種方法較為準確，但最大的問題是無法對植物的生長動態進行測量分析。RhizoTron®植物根系多功能高光譜成像分析系統基于RhizoTron®根窗技術，實現根系表型的原位連續檢測；可同時對根系和地上部幼苗進行高光譜成像、RGB成像、UV-MCF紫外光激發生物熒光高光譜成像、Thermo-RGB成像等測量分析；還可與LED培養系統、傳送系統結合，實現大樣品量的高通量自動化連續監測。
案例三、溫室效應背景下油菜的生理生態響應
氣候條件會影響植物的許多表型性狀，包括生物化學、生理、形態以及它們在地球的分布。目前，人類活動造成的溫室氣體排放使全球溫度上升，并引起一系列的全球氣候變化。因此，科學家需要預測在未來越發嚴峻的環境條件下，植物如何進行響應和調節，提前應對可能發生的生態災難，并以此為基礎培育能夠應對未來氣候條件的作物品種。
西班牙國家研究委員會的Mónica Pineda與Matilde Barón合作，利用RGB成像、UV-MCF多光譜熒光成像、紅外熱成像、高光譜等無損植物表型成像技術，研究油菜在氣候變化條件下的生長表型響應與健康狀況。他們模擬了三種不同溫度與CO2濃度的環境條件：
CCC：目前的氣候條件
RCP 4.5：基于IPCC報告推測的2081–2100年氣候條件（當前政府的氣候變化應對政策）
RCP 8.5：基于IPCC報告推測的2081–2100年氣候條件（不限制溫室氣體排放）
RGB彩色照片即可看到，在氣候變化條件下，油菜葉片逐漸變色、枯萎。多光譜熒光參數F440和F520升高，代表次生代謝水平升高（植物次生代謝一般在應對病害、干旱等脅迫因素時才會顯著升高）。多光譜熒光比值參數F680/F740升高，代表葉綠素濃度降低。紅外熱成像測量的修正葉溫TL-TA上升（葉溫減去氣溫），代表其氣孔導度下降，蒸騰作用降低，并且可能存在代謝紊亂。后續研究進一步發現，溫室效應也會改變油菜黑腐病的發病狀況。
基于高光譜成像技術，研究人員測量并計算了一系列與植物色素、脅迫、活力、光合相關的植被指數，如花青素指數ARI、類胡蘿卜素指數CRI、生病花椰菜指數DBI、歸一化植被指數NDVI和光化學反射指數PRI，并且根據研究結果提出了蕓薹屬氣候脅迫指數CSIB。這些參數指標分別與色素含量、生物脅迫指示、活力、光合作用相關。與其他植被指數相比，CSIB在實驗處理25天時即可很好地區分三種不同處理的樣品。進一步的數據分析發現，CSIB與F520有較強的相關性，暗示CSIB代表的植物生理特性也是與次生代謝有關的。
西班牙國家研究委員會這一系列研究使用的是FluorCam多光譜熒光成像系統為核心的模塊式植物表型成像系統。類似的研究工作更適于使用PhenoTron® PTS植物表型成像分析系統。這一系統采用PTS（Plant-To-Sensor）植物自動傳送技術，樣品依次自動傳送至相應成像工作站，采集多傳感器表型成像大數據，實現一站式、高通量、無損傷反射光成像、葉綠素熒光成像、UV-MCF多光譜熒光成像及紅外熱輻射成像分析等。
參考文獻：
1. Knuesting J, et al. 2018. Who will win where and why? An ecophysiological dissection of the competition between a tropical pasture grass and the invasive weed Bracken over an elevation range of 1000m in the tropical Andes. PLoS ONE 13(8): e0202255
2. Tenkanen A, et al. 2021. Strategy by latitude? Higher photosynthetic capacity and root mass fraction in northern than southern silver birch (Betula pendula Roth) in uniform growing conditions. Tree Physiology, 41(6): 974–991
3. Pineda M, et al. 2022. Health Status of Oilseed Rape Plants Grown under Potential Future Climatic Conditions Assessed by Invasive and Non-Invasive Techniques. Agronomy 12: 1845
4. Pineda M, et al. 2023. Assessment of Black Rot in Oilseed Rape Grown under Climate Change Conditions Using Biochemical Methods and Computer Vision. Plants 12: 1322
北京易科泰生態技術公司提供植物生態表型研究全面技術方案：
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